Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms