Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pitx3O35160 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pitx3O35160 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pitx3O35160 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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