Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms