Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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