Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4340L7N2C4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm4340L7N2C4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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