Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm2888K7N746 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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