Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms