Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms