Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 AU019990-203ENSMUST00000153028 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fxyd5-201ENSMUST00000009831 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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