Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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