Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm2035J3QP87 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm2035J3QP87 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm2035J3QP87 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm2035J3QP87 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
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Gm2035J3QP87 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms