Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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