Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms