Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smim18J3QNP2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smim18J3QNP2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smim18J3QNP2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smim18J3QNP2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms