Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Tmem200cJ3QK46 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem200cJ3QK46 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tmem200cJ3QK46 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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