Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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