Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms