Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms