Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms