Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6034E9Q101 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6034E9Q101 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms