Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms