Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9972E9Q053 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms