Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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