Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gcn1E9PVA8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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