Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms