Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms