Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms