Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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