Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms