Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms