Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms