Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b5A3FIN4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atp8b5A3FIN4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp8b5A3FIN4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atp8b5A3FIN4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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