Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf39A2RT81 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf39A2RT81 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf39A2RT81 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf39A2RT81 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf39A2RT81 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf39A2RT81 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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