Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Rtf1A2AQ19 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms