Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc183A2AJB1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms