Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms