Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc163A2AGD7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms