Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd5A2A8L1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms