Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Calcoco2A2A6M5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms