Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms