Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms