Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RfxankQ9Z205 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms