Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms