Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn9Q9Z0S7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn9Q9Z0S7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn9Q9Z0S7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn9Q9Z0S7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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