Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn5Q9WU28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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