Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms