Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms