Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col5a3Q9JLI2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col5a3Q9JLI2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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