Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms