Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms